PRABI
Rhone-Alpes Bioinformatics Center


Analyse de données RNA-seq sous l’environnement Galaxy, Lyon 2016

Sessions

15 et 16 novembre 2016, Lyon

Lieu : PRABI Campus de la Doua - Villeurbanne

Durée 2 journées - 14 heures

OBJECTIFS
- Acquérir les connaissances générales sur les méthodes de séquençage à haut-débit.
- Connaître les caractéristiques des données obtenues dans le cadre de l’analyse du transcriptome (RNA-seq).
- Savoir planifier une expérience simple de type RNA-seq en fonction de ses objectifs scientifiques et des caractéristiques et contraintes expérimentales.
- Connaître les principales méthodes et outils d’analyse des données RNA-seq. Pouvoir les mettre en oeuvre dans un cas simple via un serveur web Galaxy.
- Pouvoir visualiser les résultats dans un navigateur de génome.

PROGRAMME

Théorie - Introduction générale, Méthodes de séquençage

Pratique - Récupération des données, Analyse qualité

Théorie - Introduction à Galaxy

Théorie - RNA-seq : Objectifs, Plan d’expérience et Analyse de Données

Pratique - RNA-seq - Expression Différentielle

Pratique - RNA-SEQ sans génome de référence

MODALITES PRATIQUES

Public concerné
Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) ayant en projet ou en cours des expériences de RNA-seq ou ChIP-seq.

Pédagogie
Effectif maximum : 14 Personnes
Remise de support de cours
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.
Stage à 50% pratique
Chaque auditeur disposera d’un poste informatique individuel pendant la formation.

Intervenants
Mme C. Oger
M. P. Veber
M. V. Lacroix

Frais pédagogiques
1200 € HT
Auditeurs académiques 1050 € HT
Les repas sont pris en charge par Fc-3Bio

INFORMATIONS ET INSCRIPTIONS

Fc-3Bio / Dr Jean-François Prost
Tél : 04 37 66 26 55 / P. 06 27 58 28 66
30, Rue Pré Gaudry, 69007 LYON
Site Web