PRABI
Rhone-Alpes Bioinformatics Center


Formation ade4 - Initiation : Méthodes de base, Lyon 2017

Session

15 et 16 mai 2017
Lieu : salle de formation du PRABI, Campus Scientifique de la Doua, Villeurbanne

Durée : 2 jours - 14 heures

OBJECTIFS

- Maîtrise des fonctions de base du package ade4 pour R : importation/exportation des données, réalisation des graphiques adaptés à chaque type de méthode, et interprétation des sorties des analyses. Interface utilisateur graphique ade4TkGUI.

- Acquérir une autonomie dans la manipulation du logiciel pour les analyses de base à un tableau (ACP, AFC, ACM)

- Travail en commun, discussion et mise en oeuvre des méthodes d’analyse multivariées sur des données réelles, issues du packages ade4 ou provenant des participants.

PROGRAMME

- Introduction et rappels sur R. Installation du logiciel et des packages, objets, import-export de données.

- Les graphiques dans R et les graphiques d’ade4, import – export de graphiques.

- L’analyse en composantes principales, présentation et mise en oeuvre dans ade4

- Utilisation de l’interface graphique du package ade4TkGUI.

- Analyse factorielle des correspondances (AFC) et analyse des correspondences multiples (ACM).

- Présentation et mise en oeuvre dans ade4.

- Exemples d’utilisation de méthodes d’analyse multivariée avec ade4 dans R.

- Travail et discussion sur des jeux de données du package ade4 ou sur des jeux de données des participants.

MODALITES PRATIQUES

Public

Biologistes désirant passer de l’ancienne version du logiciel ade4 au package ade4 pour R, ou désirant directement s’initier à l’utilisation du package ade4 pour R. Les participants peuvent préparer un jeu de données personnel qui pourra être analysé en groupe (en fonction du déroulement du stage).

Pré-requis : utilisation d’un ordinateur personnel, connaissance des bases du logiciel R (éventuellement suivre la formation R du PRABI du 12 au 14 octobre 2016).

Pédagogie

Effectif maximum : 15 personnes
Remise de support de cours
Cours et TP sur machine, une personne par ordinateur.
Ordinateurs portables sous Linux prêtés par le PRABI pendant la durée du stage.
Si vous préférez apporter votre ordinateur, merci de le signaler à l’inscription. Connexion réseau WiFi possible (réseau "eduroam" disponible).

Intervenants

A.B. Dufour, S. Dray, J. Thioulouse

Frais pédagogiques  : € HT
Les repas sont pris en charge par Fc-3Bio.
Contact :

INFORMATIONS ET INSCRIPTIONS

Dr Jean-François PROST / fc3bio@ibcp.fr
Tél/Fax : +(33) 4 72 72 26 76 / P. 06 82 14 94 93
7 passage du Vercors - 69367 Lyon Cedex 07
Site Web